
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用淡化蛋白质组学产品,实现1000+高妙度淡化位点验出,相对稳定重演精选靶点,全方向生信探讨解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“显示”到“认证”全流程图精准服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、研究方案
02、监测数据统计
03、经“点”重演
在评测数据分析中,排除多条期刊论文中新闻报道的经典爱情靶点举例说明衣康酸绘制位点,如一号个被出现 的衣康酸共价绘制淀粉酶质KEAP1,也有糖酵解径路中的3个要点酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,、炎性小体分为淀粉酶质NLRP3和受损细胞萎缩进程中的要点淀粉酶质RIPK3等,其质谱图方式图右图。
04、物料特性
1.多个质控
企业化特女性朋友电极孵育、SDS-PAGE验测、WB手机验证、样本量想关性分享等几定位验测,确认好项目报告单靠谱性。2.高效能质谱器材公司
在Orbitrap Astral全新一波的人高签别质谱仪加持咒下,推动衣康碱化遮盖位点及淀粉酶判定新厚度,注力科学学探讨新得知。3.全流量一趟式服务保障
系统设计拜谱动物改善的实验操作公司,可供给“组织细胞培養→测试探针孵育→WB检侧→深奥度衣康酸性反应突显检侧→专属密码生信进行分析→某个位点PRM验正”全工艺流程服务性,省时省时省力更高效。05、剖析介绍(部门)
06、使用放向
PART 2、参考文献分享一下
参考文献一
用英文怎么说标题格式:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
汉语子标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
科研信息内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
资料二
日文问题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
中文名字题头:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
设计方面:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、 装修案例诞生思绪
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13极具弱于的底物组合意识,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱微生物衣康过酸体现组场地实测数据表格中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应装饰(内容如下图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱个人总结
当作TCA重复中的里面细胞细胞代谢转化物,衣康酸调高细胞细胞代谢转化、免役抗体力和细菌感染左右的充分想法,为治療免役抗体力细菌感染性症状打造了用作治療方案。衣康酸成分中的亲电性α,β-不是处于饱和状态羧酸成分能对血清质上的特异性半胱氨酸残基实行烷基化呈现(迈克尔加强想法),该全文翻译后呈现被又称“衣康酸呈现(itaconation)”,必将作用血清质功能模块,改善免役抗体力对答和细胞细胞代谢转化前提条件,为很多种症状制剂研究开发打造新一个构想。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸突显核蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医疗决对参考值靶向治疗代谢转化组(QMT1000)或热量分泌率靶向药物分泌率组护肤品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
考生学术论文
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.