T細胞都可以辨识癌证細胞界面的主耍安排相融性挽回体（MHC）呈递的抗原而晕人免役抗体发应。MHC I类(MHC-I)原子核与CD8+ T細胞完美意义，其呈递的肽主耍渠道于内源性胞质蛋清的蛋清酶体生物生物降解，而MHC II类(MHC-II)原子核主耍展示于专业抗原提呈細胞，与CD4+ T細胞完美意义，其呈递的肽来用内体途经生物生物降解的胞外和胞内蛋清(图1)。以至于，辨识由MHC原子核呈递的癌证抗原针对来设计依懒T細胞辨识和处理癌证細胞的很好的和安全的的癌证免役抗体治疗方式是至关最重要的。研究背景质谱(MS)的免役抗体肽组学（Immunopeptidomics）都可以从多种类細胞系、癌证安排和安全安排中高通骁龙量、单独认定MHC融入肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物，通过MHC抗原聚集MHC以及其运用肽，使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测，直接得到天然免疫肽字段各类译为后突显资讯，提高基因测序的真实度，并采用De novo从头到尾测序能力，不依赖现有数据库，极高通量鉴定出MHC上呈递的多肽，发现更多非典型免疫肽，而且充沛的资料剖析方式为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递肉瘤抗原的前提条件

（图源：Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023）

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经典案例分折

01 缘由钻研

稿件标题：The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

展现报刊内容：Science Advances IF：11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)是一种种核输送核蛋白，在癌症晚期中时常过表达爱，并且做好为肺部肿瘤的发生的驱动安装因素分析。现如今，靶向治疗XPO1的小大分子正被用于临床医学治疗癌症食用的药物。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用抗体肽组学，作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽，它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关，但研究发现，如果有NK细胞浸润的证据，特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此，作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原，为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 的一种原自XPO1的肽是KIR2DS2的配体

（图源：Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024）

02 癌肿-免役医治

新闻稿件之类：Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

刊发半月刊：Nature Communications IF：16.6 2023

恶意胸膜间皮瘤(MPM)有的是种功效不良的的侵蚀性良性肿瘤。原因目前拥有的医疗策划方案欠缺功效，为此十分困难还要新的医疗原则。采取其T神经元侵润，作家假说MPM有的是个适合自己的医疗性恶性肿瘤接种疫苗的总体目标。

迄今为止，对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征，对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中，作者利用研究背景质谱的免疫力肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外，作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说，作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶劣胸膜间皮瘤免疫抗体肽组学的检测

（图源：Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023）

03 有害菌mRNA肺炎疫苗制作

文章内容试题：Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

发过报刊内容：Nature Communications IF：16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加，但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原，作者通过基本概念质谱的免疫性肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中，作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽，包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白，将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答，并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点，证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌妇科感染的Hela人体体细胞和HCT-116人体体细胞中评定MHC I呈递的抗原肽。

（图源：Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022）

拜谱个人总结

抗体肽组学是蛋清质组学的同一个快捷趋势的支系，它专心致志于论述抗体系统软件中由大部分团队混溶性混合体（MHC）或人类红体肿瘤血神经元膜抗原（HLA）碳原子呈递的抗体肽。此类抗体肽是体肿瘤血神经元膜外表面呈递的肽段，要能被T体肿瘤血神经元膜辨别，最终得以打断抗体反應。来源于质谱的抗体肽组学以及是亲子签别MHC蛋清呈递肽的金细则办法，要能简单亲子签别与众不相同生理性和病理报告情形下与众不相同团队和体肿瘤血神经元膜性质中的抗体肽组，如直营瘤或宏病毒感然的体肿瘤血神经元膜。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司，可提供完善成熟的淀粉酶组学、新陈代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫查重肽组查重服务质量，通过MHC抗体特异性富集，高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术，并能精确度且真接提高免役肽编码序列，发现更加非先进典型免役肽，经过层层的需求出耐用新抗原，有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

符合文献综述

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y