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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 数据网络药学学阐述草酸钙肾结石阳极氧化应激状态和宫颈炎症断裂缘由

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿体统最应见的疾病症状的一种。肾组建中CaOx结晶过饱和点积累会致使肾小管人体细胞损坏和凋亡,而使致使肾结石的达成。短链皮下乳酸酸由肠内内好氧菌真菌面团发酵饮食棉纤维产生,仅仅在轮廓线肠内天然屏障中切实发挥的功效的功效,特别在体统质量上也切实发挥的功效根本的功效。中仅,丁酸是最丰富多彩的短链皮下乳酸酸,有消除炎症和免疫检测限制的功效,本钻研研究丁酸对CaOx肾结石的的功效以及其存在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医院专家泌尿整形科吴忠专家教授、周子健医学博士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠讲解、周子健博后在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物技术与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网络上药剂学学提供服务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

句子种类:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 企业客户单位名称:华山医院口腔科 分析喜欢的人:大鼠、HK-2生殖细胞 排列资料:对应组(Con)、3d模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱给出技术设备:系统药学学加测

构思步骤图

探讨最终结果

分析人数第一步打造大鼠整治,用生物学生化模式招生指标和团队病理学学染料等分析方式表明丁酸都可以少CaOx整治大鼠肾CaOx晶胞的形成了和受伤,有效改善CaOx整治大鼠的细菌感染受伤和钝化物的频繁表达方法。不仅,丁酸还可仰制草酸诱发的HK-2血细胞核受伤、钝化应激反应和血细胞核凋亡。 为蜡烛燃烧实验丁酸型式和靶染色体组参数库文件微信系统数据,研究探讨人数从PubChem想要高效率的获取到丁酸和丁酸酯的二维和3D型式(图1A)。借助PharmMapper参数库文件库和Uniprot参数库文件库处里后共需求出116个丁酸靶染色体组供进每一步探讨。将染色体组下拉列表导进STRING参数库文件库,采取PPI参数库文件微信系统数据探讨。Cytoscape如下了编排的前20的交通核心站靶染色体组的详尽参数库文件微信系统数据图,包涵CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。那些交通核心站染色体组与参数库文件微信系统数据中的其它的染色体组均行为 出一些 的涉及到的性,证实那些染色体组也许 利用着融合使用。GO和KEGG探讨反映了丁酸交通核心站染色体组的涉及到的方式和微生物工程工作(图1C)。交通核心站染色体组最包括与类固醇生长生长激素回应、腐蚀的应激性现象回应、几丁质酶氧血细胞对类固醇生长生长激素有趣的现象、对咸性化工物品的现象相关的。上述讲到上述一系列的,那些交通核心站染色体组最包括组织了腐蚀的应激性现象和对几丁质酶氧的微生物工程现象阶段,是肾结石产生制度化中至关为重要性的方式,这证实丁酸也许 在肾结石中利用为重要性使用。

图1| 丁酸构成与靶染色体网咯解析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进步宇宙探索丁酸对CaOx肾结石当然切靶染色体,的论述技术工人利于GEO资料统计库对GSE73680中营养健康对比与CaOx肾结石女性的染色体不同确保了的论述。对比组与CaOx结石女性的明显性不同表现染色体(DEGs)检测规定为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共筛分到3783个染色体發生明显转变,至少3379个(89.4%)染色体表现调涨,404个(10.6%)染色体表现调整(图2A)。对DEGs确保聚类分析资料分析法资料分析,热图表示了前10个被选中DEGs的二维层次聚类分析资料分析法特色(图2B)。随着,的论述技术工人依据GeneCards资料统计库人工客服电话技术鉴定了370个可以与CaOx肾结石各种涉及到的染色体,排名榜前20位的预侧染色体和其各种涉及到性评分标准如下图2C随时。为了让寻找丁酸根治CaOx肾结石的重要的靶点,的论述技术工人将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石各种涉及到染色体净化处理获取一个多个Venn图。从而,CYP2C9被确保为丁酸关系CaOx肾结石的自身靶点(图2D)。与此同时,的论述技术工人还确保了丁酸与CYP2C9的大分子连通,CYP2C9的6个蛋白质残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸彼此的功效,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在使用线上药学学分折CYP2C9是丁酸直接影响CaOx肾结石的靶遗传基因后,设计人工还顺利通过神经体细胞實驗证明了CYP2C9可拉低草酸诱导型的HK-2神经体细胞的ROS品质、疾病磨损和凋亡。

图2| 基本上据库协力讲解預測CYP2C9是丁酸使用于CaOx肾结石的靶表观遗传

研究探讨结果显示

本科学研究前提会得知丁酸在肚子里和肚子里均能治理和改善CaOx肾结石模板的硫化的应激性性和宫颈疾病挫裂伤,那么实现系统上药剂学学建立达到丁酸关系CaOx肾结石的自身靶点——CYP2C9,第三实现组织研究灵魂存在CYP2C9在草酸盐分析的HK-2组织ROS标准、宫颈疾病挫裂伤和凋亡。以上会得知发现丁酸或许实现治理和改善CYP2C9来治理和改善CaOx肾结石的硫化的应激性性,解决宫颈疾病挫裂伤。某一整个过程中拜谱微生物体保证了系统上药剂学学新技术应用保障,显然拜谱微生物体可提生成熟期成熟的的人类基因组学、胆固醇质组学、新陈代谢组学等两组学产品的及新技术应用保障,祝贺致电的方式资讯! 分类文献综述:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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